急性胰腺炎有后遗症。胰腺是重要的消化器官，分泌胰淀粉酶、胰蛋白酶、胰脂肪酶等消化酶，进入肠道后促进食物消化。 但患急性胰腺炎后，消化酶不会进入肠道，而在胰腺组织内部自行消化。由于自行消化破坏了胰腺组织会有后遗症，特别是重症胰腺炎，常见的后遗症有糖尿病、胰腺囊肿，还有胰腺外分泌功能不足。 若反复患胰腺炎，最后会导致消化功能、脂肪的消化减弱，甚至影响肢体健康。
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