乙肝大三阳患者如果出现肝功能异常，转氨酶水平如果大于两倍，病毒量也高，影像学检查提示有肝硬化或严重的肝纤维化，建议给予抗病毒治疗，但还要继续监测抗病毒的效果或者不良反应。 如果乙肝大三阳患者只是肝功能偶然有轻度异常，没有两倍以上，病毒量不是很高，可以做肝穿刺检查，评价是否需要给予抗病毒治疗。 如果不满足抗病毒治疗指征，可以给予适当的保肝治疗，改善肝功能异常。要长期监测，明确肝功能是否还会出现反复、持续的异常，再确定下一步的治疗方案。
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