对于胆囊腺肌症是否会癌变，目前还有一些争议。绝大多数胆囊腺肌症属于局限性腺肌症，表现为胆囊底部、胆囊壁局限性的增厚。通过临床观察，局限性的腺肌症通常没有发生癌变的风险，而有些弥漫性的胆囊腺肌症，或者是节段性胆囊腺肌症，则有合并癌变的可能。通过一些基因的检测发现，其实胆囊腺肌症和胆囊癌是具有完全不同的基因表现。所以，目前大多数学者，通常不把胆囊腺肌症作为一种癌前病变。对于绝大多数胆囊腺肌症，建议是定期检查，观察其变化，而对于节段性或者是弥漫性腺肌症，还是建议外科手术治疗。
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