骨髓造血功能不良要针对原因进行治疗，原因不同，即使是相同的诊断，采用的治疗方式也会有所不同。还要针对患者的体质，给予个体化的治疗。 如再生障碍性贫血，考虑是免疫攻击造成，会采用免疫抑制剂的治疗。 对于恶性血液系统疾病造成的，要采用化疗，杀伤恶性细胞，才能够恢复正常造血的功能。
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