安装心脏起搏器有一定副作用，因为所有的医疗操作都可能存在副作用，但是植入起搏器的优势要大于弊端。 安装起搏器的患者，可能发生的副作用包括： 1.局部刀口不愈合、感染，或起搏器植入的囊袋出现感染。 2.起搏导线在血管内可能会造成感染性的心内膜炎、局部血栓。 3.起搏导线阻挡三尖瓣的关闭，造成三尖瓣关闭不全。 4.起搏器源性的心律失常。 5.起搏器本身属于金属材质，可能会受到磁场的干扰，在过安检时可能会对生活造成不便。
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