肾区的疼痛主要见于两大方面。一个是有关肾脏的问题，肾脏病一般情况下不会引起疼痛，但是出现了感染，比方肾盂肾炎、肾周脓肿，累及肾脏被膜的时候会出现疼痛。再有就是合并肾结石、输尿管结石，结石在活动的情况下也可以引起肾区的疼痛。肾癌晚期也会引起腰痛。这是引起肾区疼痛有关泌尿系的疾病。除了这些疾病以外，肾区还有肌肉组织，包括神经压迫或者腰椎等疾病，也可以引起肾区的疼痛。临床出现肾区疼痛的时候要区分病因，根据不同的病因，给予不同的治疗。
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