新型冠状病毒侵犯人体后，主要会对肺造成危害，也会侵犯到其他的系统。肺如果受到侵犯，可能会引起呼吸困难、呼吸衰竭，严重的可能会危及生命。肺部受到病毒侵犯后，尤其是出现免疫损伤以后，会引起通气功能障碍，使需要的氧不能正常输送到全身，可以造成呼吸衰竭。新冠病毒还可以导致心功能衰竭，引起神经系统的损害，出现昏迷，还有嗅觉、神经系统的损伤。还可能引起肝功能改变，引起血液系统的异常，使病人失去工作能力，甚至失去生命。
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