最常见的引起胚胎发育停止的原因，是胚胎的染色体原因。比如胚胎有21-三体、18-三体、16-三体、单倍体或者有平衡的移位，这些染色体的异常，都会造成胚胎早期的发育停止、流产。另外，引起胚胎发育停止的原因，有妈妈的因素。比如妈妈有严重的全身性疾病，心衰、严重的感染，严重的贫血等等。或者爸爸的染色体也有问题，精子的畸变率高，也会容易发生胚胎发育停止。其他环境因素，比如在含砷、苯环境当中长时间工作，也会引起胚胎发育的停止。总之，早孕期是非常容易出现这种情况。
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