它主要检查就是血培养，血培养阳性是诊断感染性心内膜炎的重要依据。凡原因未明的发烧，体温持续在一周以上，却有心脏病的病史，应该积极多次的抽血培养，以提高阳性率。另外一个，超声心动图检查，超声心动图检查可以检出直径大于两毫米以上的赘生物，因此对诊断感染性心内膜炎很有帮助。另外，在治疗过程中，超声心动图还可以动态观察赘生物的大小、形态、活动和瓣膜的功能，决定是否以后要做手术。另外一个就是ct的检查，包括怀疑有颅内病变的，应该做ct，了解病变的部位和范围。
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