手术治疗颅脑肿瘤有一定的风险，手术是一种有创伤的治疗手段，任何手术都有相应的风险。颅脑肿瘤也不例外。一般而言，颅脑肿瘤手术的风险主要包括两个方面。一方面是手术和麻醉本身的风险并发症，比如术区的出血、感染、手术损伤等等。尤其是位于功能区，或者已经侵犯重要血管神经结构，并发症往往很严重。还有一部分风险来自患者自身条件和肿瘤本身，例如患者合并高血压、糖尿病、高龄等相关的脏器功能不全，肿瘤侵犯重要的结构很难全切，甚至恶性程度较高，术后很快复发等等风险。
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