急性肠炎最常见的病因是细菌及其毒素的感染，比如吃到的污染的家禽、肉、鱼，或者是感染的蟹、螺等海产品，或者是被金黄色葡萄球菌污染的剩饭、剩菜、肉食品，都容易导致急性肠炎的发生。物理化学的因素也会导致急性肠炎，如食用生冷食品或者是一些特殊的药物，比如水杨酸制剂、磺胺类的药物，或者是一部分抗生素，或者是误服了强酸、强碱、农药都可能导致急性肠炎的发生。
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