左右交替着头疼的原因大致如下:1.神经性头疼的表现。主要的发病诱因是长期休息不好,过度的脑力劳动以及生活中各种压力等,多种神经性因素扰乱了大脑神经的正常生理功能,表现出左右交替头疼的症状。2.颅内血管畸形导致局部血液供应障碍,出现缺血缺氧性改变,表现出剧烈的头疼不适,伴有恶心、想吐等症状。3.高血压的表现。由于血管内压力持续升高导致脑血管扩张,表现出上述头疼症状。因此,建议先明确病因后在医生的指导下对症治疗。