在临床上，精子形态学选择微注射的适应症有：第一，前次单精子显微注射失败不明原因者。第二，试管婴儿治疗反复多次失败，无明显原因的反复流产。第三，严重精子畸形症。第四，从睾丸或附睾取经患者。第五，多次流产，且精子形态评估中精子头部空泡比例高者。第六，采用供卵治疗，而精子形态评估中评估低的患者。第七，超过35岁以上男性，以往无卵子因素的周期治疗失败患者。第八，多次试管周期中没有或较少优质胚胎者。第九，低于25%受精率或无受精患者。
