先天性胆总管囊肿手术在术中会不可避免的损伤胆道系统,大部分患者术后出现消化不良的症状,多为术后的应激性反应,主要是因为手术损伤了胆道系统,包括吻合口的水肿等情况,造成胆汁的分泌和排泄受到一定影响。而胆汁对食物,尤其是以脂类食物的消化吸收具有重要作用,如果胆汁的分泌和排泄出现异常,会导致机体的消化不良,一般术后1周左右即可恢复。但是如果是吻合口狭窄或肠原性损伤,则需要再次手术解决问题,在术后恢复期内,注意肠外营养支持,防止电解质紊乱。