慢性肛裂大多需要手术治疗。少部分的慢性肛裂患者可以通过使用药物扩肛等非手术治疗方法治愈。但大多的慢性肛裂由于裂口已经形成慢性溃疡,会伴有便秘症状,而且症状大多都偏重,经用药保守治疗并无法使裂口愈合,最终需要通过手术治疗才能完全治愈。手术时需要切除慢性肛裂的裂口以及其附属物,包括肥大的肛乳头和哨兵痔,并且需要切断部分肛门内括约肌,降低肛管内压力,防止术后肛裂复发。