结缔组织疾病累及胃肠道的有硬皮病、系统性红斑狼疮、结节性多动脉炎、皮肌炎、类风湿性关节炎等,其中以硬皮病最为突出。以抗生素和糖皮质激素为主要治疗,对于硬皮病患者药物治疗是首选,抗生素能抑制腹腔内细菌繁殖使粪便脂肪和维生素B12的特征性吸收障碍,在几天内恢复正常。对于系统性红斑狼疮患者,常用肾上腺皮质激素与硫唑嘌呤药物,对于大面积肠出血或穿孔的患者应尽早手术治疗,积极治疗疾病可以延缓疾病的进展。