无睾症的发病机制目前并没有完全的确定，可能和以下几个因素有关：第一，在胚胎发育过程中，由于受到病毒、药物，甚至生活环境的干扰，使性腺发育障碍，也算是一种基因异常。第二，在妊娠期或出生前后就出现睾丸扭转，精索血管栓塞，致使睾丸血流出现供应受阻，而使睾丸萎缩，这可能也是一个常见的病因。出现这些问题也不用过度地担心，如果是单侧的睾丸缺失，只需要进行营养调节，一般不影响生育。但是如果两侧睾丸都缺如，几乎是没有生育的能力。
