沙眼衣原体感染越早治疗效果越好，防止并发症的发生，治疗后要定期到医院复诊化验检测。病原体是否已经转阴，性伴侣需要同时治疗。避免再次复发的感染，由于大多数患者症状不明显。导致沙眼原体长期潜伏感染。上行蔓延容易导致并发症的发生，建议有过性生活的女性，可以常规的筛查衣原体的感染。
