涎腺囊肿可以采取药物和手术治疗的方式来处理。药物治疗可以选用过氧化氢溶液或磺胺类抗菌药治疗。其中过氧化氢溶液可局部冲洗和含漱，可达到氧化杀菌的目的；磺胺类抗菌药可以起到抗菌作用，适用于手术前后感染严重或有并发症者。但是，该病治疗以手术治疗效果较好，手术切除囊肿的同时切除腺体，直接切除病灶。适用于囊肿范围较大及发生脓肿等患者，降低复发率，即使残留部分囊壁不会影响治疗效果。
