矮小症病因较多，较复杂。部分矮小症属于天生性的，即先天性。如家族性遗传性矮小、染色体病变、基因突变、特纳氏综合症、先天代谢性疾病、脑发育迟缓等引起的矮小，均属于先天性。后天性引起的矮小常见的有特发性矮小、垂体病变、生长激素缺乏症、慢性疾病、骨骼系统疾病、营养不良、肥胖症、性早熟、早产儿、低体重儿、睡眠障碍等。
