手足口病早期的临床表现不典型，可能与上呼吸道感染以及消化系统感染疾病有所相似，可能会出现精神不好、咳嗽、打喷嚏、流鼻涕、鼻塞、咽喉部疼痛等症状。部分患者也可能会出现大便次数增多，伴有恶心、呕吐、食欲下降等临床表现。随着疾病的进展，加上患者的抵抗力下降时，有可能会导致患者出现手、足、口腔等部位长水泡，极少部分患者还可能会伴有皮肤瘙痒症状。如果出现了神经系统病变时，患者还可能会出现烦躁、嗜睡，以及长时间的哭闹不安、四肢抖动。
