结肠炎按照病因分类可分为:炎症性肠病,是一种和免疫相关而病因未明的肠道炎性疾病,包括克罗恩病、溃疡性结肠炎和其他未定性结肠炎,治疗相关性肠炎,包括化学性结肠炎和放射性结肠炎,其中化学性结肠炎多由肠内注射化学药物引起。放射性结肠炎,多由接受放疗后引起。缺血性肠炎,由于肠道血供减少而产生。感染性肠炎,如细菌性痢疾,阿米巴痢疾等感染相关致病菌引起。伪膜性肠炎,由梭状芽孢杆菌引起,常见于免疫功能低下者抗生素治疗后;还有不明原因的结肠炎。