红斑狼疮的病因目前尚不完全明确，可能与遗传、内分泌、环境、感染等因素有关。遗传因素在红斑狼疮的发病中起到一定作用，有家族史的人患病风险可能会增加。环境因素也是重要原因，包括紫外线照射、环境潮湿、感染等，其中病毒感染，如腮腺炎病毒感染在红斑狼疮的发病中也起到一定作用。
另外，雌激素水平与红斑狼疮的发病也有关。有研究表明，红斑狼疮患者发病前有妊娠或口服避孕药的情况，提示雌激素水平与发病有关。在某些诱因刺激下，如环境刺激（如阳光暴晒、药物诱发等），可能会诱发红斑狼疮。
