卵巢畸胎瘤的治疗以手术切除为主，根据肿瘤性质、大小及患者年龄等因素制定个性化方案。
大多数卵巢畸胎瘤为良性成熟性畸胎瘤，可通过腹腔镜或开腹手术完整切除，保留正常卵巢组织，尤其对年轻患者尤为重要。若肿瘤为恶性未成熟畸胎瘤，需扩大手术范围，可能切除患侧卵巢甚至子宫，术后结合化疗或放疗。孕期发现的畸胎瘤若无并发症可暂观察，分娩后处理。
术后需定期复查超声和肿瘤标志物，监测复发；恶性畸胎瘤患者应严格随访；突发腹痛可能提示肿瘤扭转或破裂，需急诊就医；计划妊娠者应提前评估卵巢功能。治疗需由妇科或肿瘤专科医生指导，避免延误病情。
